एथेंस में आयोजित 1906 का ओलंपिक असाधारण साबित हुआ क्योंकि इसके आयोजकों ने खेलों के बीच पारंपरिक चार साल के ब्रेक की आवश्यकता का पालन नहीं किया। इस कारण से, ओलंपिक को अंतर्राष्ट्रीय ओलंपिक समिति द्वारा आधिकारिक तौर पर मान्यता भी नहीं दी गई थी।
1906 के खेल पहले ओलंपियाड की दसवीं वर्षगांठ मनाने के लिए आयोजित किए गए थे, जो एथेंस में भी आयोजित किया गया था। दो घटनाओं के बीच संबंध पर और जोर देने के लिए, ओलंपिक के आयोजकों ने 1896 में उसी प्रतियोगिता योजना को चुना। अधिकांश भाग के लिए, प्रतियोगिताएं मार्बल स्टेडियम में आयोजित की गईं।
सबसे पहले, जब 1906 में ग्रीस से ओलंपिक आयोजित करने का प्रस्ताव मिला, तो IOC ने स्पष्ट इनकार नहीं किया। तथ्य यह है कि उस समय तक ओलंपिक खेलों की प्रतिष्ठा गिर चुकी थी, और जनता ने अब उनमें पूर्व रुचि नहीं दिखाई। ओलंपिक आंदोलन के अंतिम पतन को रोकने के लिए, उपाय करना आवश्यक था, और अब 1908 तक प्रतीक्षा करने का अवसर नहीं था। और हालांकि आईओसी ने बाद में 1906 के ओलंपिक को मान्यता देने से इनकार कर दिया, इसे खेलों का उद्धार कहा जाएगा, जिसने जनता और विशेष रूप से एथलीटों को इस कार्यक्रम में वापस आने की अनुमति दी, आंदोलन और इसके विचार का समर्थन करने के लिए।
कठिनाई इस बात में भी थी कि, परंपरा के अनुसार, ओलंपिक को दुनिया के विभिन्न देशों में आयोजित किया जाना था, लेकिन 1906 में इस आयोजन को ग्रीस में आयोजित करने की योजना बनाई गई थी, जिससे आईओसी के सदस्यों में असंतोष था। वैसे तो कोई और, लेकिन 22 अप्रैल को खेलों का भव्य उद्घाटन हुआ। जैसे ही मीडिया ने १९०६ के ओलंपिक पर ध्यान केंद्रित किया, कई एथलीट और मेहमान एथेंस पहुंचे।
इस कार्यक्रम में 20 देशों के लगभग 900 एथलीटों ने भाग लिया, जिनमें सात महिलाएं भी शामिल थीं। 1906 के ओलंपिक के हिस्से के रूप में, निम्नलिखित खेलों में प्रतियोगिताएं आयोजित की गईं: भारोत्तोलन, ग्रीको-रोमन कुश्ती, तलवारबाजी, नौकायन, नौकायन, तैराकी, गोताखोरी, एथलेटिक्स, ट्रैप और बुलेट शूटिंग, साइकिल चलाना और टेनिस। दुर्भाग्य से, चूंकि आईओसी ने १९०६ के ओलंपिक को मान्यता नहीं दी थी, इसके प्रतिभागियों द्वारा प्राप्त सभी पुरस्कार अमान्य थे और भविष्य में उन पर ध्यान नहीं दिया गया था।
ओलंपिक का समापन समारोह 2 मई को हुआ था। आयोजन की समाप्ति के बाद, इसके परिणामों पर विभिन्न देशों में लंबे समय तक चर्चा हुई, जिससे खेलों में सार्वजनिक रुचि काफी बढ़ गई। यह 1908 के लंदन ओलंपिक के दौरान विशेष रूप से ध्यान देने योग्य हो गया, जिसमें 2,000 से अधिक एथलीटों ने भाग लिया था।